Modo fácil: Comienza un juego tras morir tres veces aparecerá un mensaje indicándote que una nueva configuración fácil está disponible. En este modo no podrás conseguir el rango "Onimusha".

Modo difícil: Para conseguir este Modo deberás completar con éxito el juego en Dificultad Normal.

Modo super difícil: Para conseguir este Modo deberás completar con éxito el juego en Dificultad Difícil.

Modo Crítico: Para conseguir este Modo deberás completar con éxito el modo Equipo Onimusha.

Bonus Finales: Cuando hayas completado el juego, obtendrás la opción del mini-juego Men In Black y modo Equipo Onimusha.

Modo equipamiento duro: Cuando hayas conseguido completar el juego en dificultad difícil, al comenzar un nuevo juego tendrás la espada Blazing Fire, 20.000 en dinero, 30 medicinas, 10 madera y todos los 3 niveles de armadura, munición infinita y habilidad siempre a tope.